Program KSI3 Pro umożliwia (w zależności od potrzeb użytkownika) pełną kontrolę przepływu gotówki w firmie. W momencie zarejestrowania dowolnej transakcji dla której jako formę płatności wybrano gotówkę lub czek, program automatycznie utworzy odpowiedni dokument kasowy KP lub KW z odnotowaniem: daty i godziny wpłaty (wypłaty) pieniędzy, numeru transakcji, z którą związany jest ruch gotówki oraz operatora, który dokonał wpłaty (wypłaty) pieniędzy.
Oprócz odnotowywania w programie przepływu pieniędzy możliwy jest wydruk właściwego dokumentu kasowego KP lub KW związanego z operacją finansową. Wydruki mogą być realizowane automatycznie (bez ingerencji użytkownika) w momencie zatwierdzenia transakcji lub na życzenie.
Funkcje programu umożliwiają bieżącą kontrolę stanu kasy na poszczególnych stanowiskach sprzedaży, ogólnego stanu kasy w firmie jak również pozwalają rozliczać poszczególnych kasjerów (istotne w przypadku prowizyjnego rozliczania sprzedawców). Możliwość tworzenia dziennych lub okresowych raportów kasowych zapewnia łatwą kontrolę stanu gotówki w firmie.
Dodatkowym ułatwieniem w zarządzaniu przepływem gotówki jest możliwość dokonywania bezpośrednio w programie wydruków przelewów bankowych na konta kontrahentów oraz Bankowych Dowodów Wpłaty przy przekazywaniu dziennych utargów do banku.